湖南农业大学卓越工程师学院是贯彻落实党的二十大“关于加快拔尖创新创业人才培养”的要求，根据省委省政府有关决定精神，作为湖南湘江科创院五所试点大学（湖南农业大学、中南大学、湖南大学、湘潭大学、长沙理工大学）之一成立的新型学院，是拔尖创新创业人才培养的先导区，是新工科新农科协同建设的试点区。学校自2024年起每年从新生中择优选拔40名左右同学进入学院学习。

卓越工程师学院依托本校特色专业和优势学科，聚焦“智慧农业、智能小农机和农业无人技术”三大特色领域，联合行业内一流企业，以“新农科、新工科深度交叉融合”为切入点，培养具有深厚基础理论、系统专业知识、广阔国际视野的创新创业型人才。

学院组建了农业机械、生物、化学、材料、计算机科学与技术等跨学科教学团队，聘请了国内一流企业的专业技术骨干担任兼职教师，建立了创业导师库，以孵化创业项目为核心目标，全方位指导学生掌握专业技术、运营思维、领袖精神、拓展能力等，重点培养学生成为领域未来的创新企业家和卓越工程师。

学院课程体系主要包括：以“设计与自然”和“产品设计”等为主要内容的设计类课程；以“工程原理”和“机器人基础”等为主要内容的工程与技术创新类课程；以“机器人数学”“生物”和“化学”等为主要内容的数理与科学类基础课程；以“科学发展史”和“人文与自然”等为主要内容的通识教育类课程；以及以“科创训练实践项目”和“校企联合攻关项目”等为主要内容的实践类课程等。

经过四年严格培养，达到合格标准的同学可根据意愿选择“智慧农业、机械设计制造及其自动化、智能科学与技术”三个专业之一作为毕业专业。